姚瑞蓮

副研究員

  • 電話:+86-021-34208573
  • 郵箱:yaoruilian@sjtu.edu.cn
  • 地址🦮:東川路800號系統生物醫學研究院C405

學術經歷

  • 2006年於華東理工大學理EON4應用物理系獲學士學位✍🏼,2013年於日本國立九州工業大學信息科學和系統工程EON4生命科學和生物信息學系獲信息工學博士學位🕵🏼‍♂️。2013年10月起在EON体育4平台(微生物代謝國家重點實驗)生物工程系工作😓。2020年12月至今,受聘為副研究員。

研究方向

重大疾病的發生、發展和轉歸的機製的研究

通過13C代謝流量分析揭示代謝活動的基本規律,為各類代謝性疾病和腫瘤發生提供進行幹預的理論依據。

工業微生物代謝流計算分析方法和軟件平臺的開發

基於代謝組學及動態同位素示蹤技術🍥,穩態和非穩態13C代謝流分析,建立工業菌株動態代謝網絡的代謝流集成平臺⛅️。

13C代謝流量分析

代謝流量組學,反映基因-蛋白-代謝物之間的相互作用對代謝網絡的綜合效應。13C代謝流量分析在推動代謝工程和合成生物學從窮舉試錯法到理性設計轉變,發揮至關重要的作用。此外🏊🏼‍♂️,由於這項技術能夠用於確定細胞能量來源🧑🏼‍🚒、疾病代謝狀態異質性和藥物引起的代謝變化,也已成功應用於生物醫藥與大健康領域🖱。

代表論著

  • •  
    • 姚瑞蓮; 13C代謝流量分析發展30年, 生物工程學報, 2021, 37(5): 1510-1525.
    •  

    Ruilian Yao, Jiawei Li, Lei Feng, Xuehong Zhang, Hongbo Hu. 13C metabolic flux analysis-guided metabolic engineering of Escherichia coli for improved acetol production from glycerol. Biotechnology for Biofuels, 2019, 12:29

    •  

    Ruilian Yao#, Di Liu#, Xiao Jia, Yuan Zheng, Wei Liu, Yi Xiao. CRISPR-Cas9/Cas12a biotechnology and application in bacteria. Synthetic and Systems Biotechnology, 2018, 3(3): 135-149.

    •  

    Ruilian Yao, Keli Pan, Huasong Peng, Lei Feng, Hongbo Hu, Xuehong Zhang. Engineering and systems-level analysis of Pseudomonas chlororaphis for production of phenazine-1-carboxamide using glycerol as the cost-effective carbon source. Biotechnology for Biofuels, 2018, 11:130.

    •  

    Ruilian Yao, Dewang Xiong, Hongbo Hu, Masataka Wakayama, Wenjuan Yu, Xuehong Zhang, Kazuyuki Shimizu. Elucidation of the co-metabolism of glycerol and glucose in Escherichia coli by genetic engineering, transcription, profiling, and 13C metabolic flux analysis. Biotechnology for Biofuels, 2016, 9:175.

  • •  

    Ruilian Yao, Qing Liu, Hongbo Hu, Thomas K. Wood, Xuehong Zhang. Metabolic engineering of Escherichia coli to enhance acetol production from glycerol. Applied Microbiology and Biotechnology, 2015, 99(19):7945-7952.

  • 1. EON体育4“交大之星”計劃醫工交叉研究基金,氧化磷酸化抑製劑聯合DYRK1A抑製劑治療肝癌的作用及分子機製研究✦,2021/1-2023/12,合作主持(工方)
  • 2. 國家重點研發計劃👨‍🚒,新型工業微生物全基因組代謝網絡模型的優化設計和構建研究,2020/1-2024/12✷,子課題主持
  • 3. 國家重點實驗室開放基金🔍🥮,基於非穩態 13C代謝通量分析的海洋擬諾卡式菌的 1,6-二羥基吩嗪的合成,2018/1-2019/12🥷🏻,主持
  • 4. EON体育4新進教師啟動計劃,基於非穩態13C代謝通量分析的吩嗪-1-甲酰胺高產菌的構建,2018/1-2020/12🧜🏼‍♂️,主持
  • 5. 國家自然科學基金青年基金🕘,基於雙底物平行標記實驗的13C代謝通量分析的新方法🛠,2015/1-2017/12🙋🏿‍♂️,主持
  • 6. 橫向,上海慧譜信息科技中心,C13代謝流的檢測分析(第二批)🙆🏽‍♂️,2020/8-2024/8,主持
  • 7. 橫向,上海賀普藥業股份有限公司🚴🏿‍♀️,膽汁酸濃度檢測及C13代謝流的檢測(第三批),2020/9-2024/9🚴🏻,主持

承擔項目

學生培養

  • 在讀學生
  • 畢業學生
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