魏冬青

長聘教授

  • 電話🙆👩🏼‍🔬:+86-021-34204573
  • 郵箱:dqwei@sjtu.edu.cn
  • 實驗室網址🙅🏽:tacc2008.sjtu.edu.cn
  • 長聘教授, 皇家化學學會會士,Springer Nature SCI期刊"Interd. Sci. – Comp. Life Sci."主編🫲🏻🧑🏽‍🚀, 高被引學者, 發表論文600多篇🦝,引用1萬6多次👩🏽‍✈️,H-index 70, H10-index 331,在交叉學科多個領域做出了開拓性工作

學術經歷

  • 1987年7月在美屬波多黎各大學獲博士學位 
  • 1987年8月-1992年12月加拿大不列顛哥倫比亞大學做博士後研究和研究學者 
  • 1993年1月-2006年2月加拿大計算及其應用研究中心,任研究員 
  • 2000年2月-2000年7月北京大學教授 
  • 2002年1月起任加拿大康克迪亞大學分子設計研究中心成員(兼職) 
  • 2003年1月-2006年1月,天津市及天津師大特聘教授(海河學者)🅾️,天津大學博士生導師🀄️,生物信息與藥物開發研究所所長 
  • 2006年2月起任EON体育4生物信息與生物統計系教授及長聘教授👦,博士生導師, 以及微生物代謝國家重點實驗室成員 

研究方向

結構生物信息學以及AI輔助藥物設計

Structural Bioinformatics and AI Drug Design

把AI最新技術應用於pHLA結合預測、新抗原鑒定和HPV疫苗設計🐁。

通過虛擬篩選獲得治療阿爾茲海默症的候選藥物wgx-50(花椒素),通過分子模擬和大量實驗分析其作用機製💇🏽‍♀️,開發治理阿爾茲海默症藥物🙋🏽。

通過分子模擬和自由能計算,揭示抗流感病毒藥物抑製病毒質子通道蛋白(M2)的分子機理及一些抗藥性突變的產生機製。

 

代表論著

  • •  

    Cited 78 times -Jing Chang, Peng Lian, Dong-Qing Wei*, Xiang-Rong Chen, Zizheng Gong and Qingming Zhang, “Thermal decomposition of the solid phase of nitromethane: Ab initio molecular dynamics simulations”, Phys. Rev. Lett. 105, 188302 -188305(2010).

    •  

    Cited 34 times -Ruo-Xu Gu, Limin Angela Liu*, and Dong-Qing Wei*, “Free Energy Calculations on the Two Drug Binding Sites in the M2 Proton Channel”, J. Am. Chem. Soc., 133 (28), 10817–10825(2011).

    •  

    Cited 45 times - Maoping Tang, Zhaoxia Wang, Ying Zhou, Wangjie Xu, Shengtian Li,Lianyun Wang, Dong-Qing Wei*, Zhongdong Qiao*, “A novel drug candidate for Alzheimer disease treatment - gx-50 derived from Zanthoxylum Bungeanum”, J. Alzheimer’s Disease, 34, 203–213 (2013).

    •  

    (Cited 341 times) Wei, D. and G. Patey, "Orientational order in simple dipolar liquids: computer simulation of a ferroelectric nematic phase". Physical review letters, 1992. 68(13): p. 2043-2045.

    •  

    (Cited 180 times) Wei, D. and D. Salahub, "Hydrated proton clusters and solvent effects on the proton transfer barrier: A density functional study". The Journal of chemical physics, 1994. 101(9): p. 7633-7642.

  • •  

    (Cited 139 times) Chu, Y., A.C. Kaushik, X. Wang, W. Wang, Y. Zhang, X. Shan, D.R. Salahub, Y. Xiong, and Wei D.Q., "DTI-CDF: a cascade deep forest model towards the prediction of drug-target interactions based on hybrid features". Briefings in Bioinformatics, 2019, doi: 10.1093/bib/bbz152.

    •  

    (Cited 113 times) Wang, C., Wang, S., Li, D., Wei, D.Q.*, Zhao, J*. and Wang, J.*, “Human intestinal defensin 5 inhibits SARS-CoV-2 invasion by cloaking ACE2”. Gastroenterology, 2020, DOI: 10.1053/j.gastro.2020.05.015.

    •  

    (Cited 51 times)  Chu, Y., Zhang, Y., Wang , Q.K., Zhang, L.F.,  Wang, X.H., Wang, Y.J., , Salahub, D.R., Xu, Q.., Wang, J.M., Jiang,  X., Xiong, Y*,  and Wei, D.Q.*,  “A transformer-based model to predict peptide–HLA class I binding and optimize mutated peptides for vaccine design”,  Nature Machine Intelligence, 2022, 4(3):300-311, DOI: 10.1038/s42256-022-00459-7 (2021).

獲獎情況

  •  獲得上海市科技進步一等獎,中華醫學二等獎,計算機學會自然科學二等獎🚶🏻,上海交大科技獎,第五屆焦善慶研究獎,年上海交大橫山亮次獎。
  • “基於圖深度學習和多標簽學習的藥物-靶標相互作用預測方法研究”,國家自然科學基金面上項目,項目編號🤷🏻‍♀️:32070662,2021.1-2023.12🧑🏻‍🔬,項目主持人。
  • “經典名方溫膽湯精準臨床定位決策體系”, EON体育4“交大之星”計劃,醫工交叉研究基金,項目編號:YG2021ZD02🧑🏻‍🔧,2021.1-2023.12,共同主持人🧼。
  • “人工智能輔助的酶定向進化研究”, 國家自然基金委重點項目🏣,項目編號:32030063💵, 2021.1-2024.12, 項目參與人🤷🏿。
  • “人工智能抗新冠狀病毒藥物與疫苗設計與實驗評估”🧖🏻📷, 廣東省創新戰略專項資金(廣東防控新冠狀病毒感染科技攻關應急專項)🙅🏿‍♀️, 2020.5-2021.4👷🏻,項目主持人。
  •   ”蛋白-蛋白相互作用及其網絡的理論計算新方法和應用”🕵🏽,國家重點研究領域,項目編號:2016YFA0501703,2016.1-2020.12,  項目負責人 。
  • “高通量蛋白質組學計算的基礎理論與算法”,項目編號:61832019,國家基金委重點項目,2019.1-2023.12, 項目參與人。
  •  “SCI期刊《Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences》一流期刊建設”,上海市高水平高校學術期刊支持計劃, 項目負責人🫅🏻。
  •  “經典中國國際出版工程”,《轉化醫學信息學》♏️, 項目主持人。
  •  “養殖廢棄物安全資源化利用技術與研究及應用”👈,國家科技部-“十二五”科技支撐計劃🎅🏼,項目編號🦋🌆:2013BAD21B03🐽,2013-2016, 項目負責人⏲👷🏼‍♂️。
  •  “地球深部碳循環的物理與化學”,東方科學論壇,2014, 項目負責人👩🏻‍🔬。
  • “985三期國際期刊專項”,上海交大, 2013-2014, 項目負責人。
  • “個性化藥物設計軟件與藥物虛擬篩選服務”,國家技術創新基金📨,項目編號:238312C26213202383,2012-2015,50萬元🏷,項目負責人🤧。
  •  “基於中西藥學融合的靶向發現與藥物分子設計技術”,國家863💤,項目編號:2012AA020307,2013-2015, 項目負責人。
  • “典型炸藥爆炸機理的量子分子動力學研究”,國家自然科學基金,項目編號: 11174201, 2012-2015,60萬元,項目負責人,已結題🌳。
  •  “分子模擬與計算機輔助藥物設計”,國家科學技術學術著作出版基金🧘‍♂️👵🏼, 2012-2013,項目主持人🤰。
  •  “藥物代謝酶SNPs與藥物的類藥性一體化預測軟件的研究與開發”, 國家863計劃生物信息專項👩🏼,項目編號:2007AA02Z333𓀘,2007-2011,  項目負責人👩🏽‍🎤。
  • “阿爾茨海默氏症天然藥物的設計、篩選以及相關的理論研究”🤙🏿,國家自然科學基金🚛,項目編號:30870476, 2009-2011 ,項目負責人。 
  • “重大新藥創製”科技重大專項“十一五”計劃第二批課題, 綜合性新藥研究開發技術大平臺, 9600萬元, 項目編號2009ZX9301-007, 項目參與人。 
  • “復雜環境化學反應體系的理論計算方法與應用研究”👨🏿‍⚖️,國家自然科學基金,項目編號:20773085, 2008-2010, 項目負責人。

承擔項目

EON体育4平台专业提供:EON体育4平台⏭、EON体育4🫄🏽、EON体育4登录等服务,提供最新官网平台、地址、注册、登陆、登录、入口、全站、网站、网页、网址、娱乐、手机版、app、下载、欧洲杯、欧冠、nba、世界杯、英超等,界面美观优质完美,安全稳定,服务一流,EON体育4平台欢迎您。 EON体育4平台官網xml地圖