近日☕️,合成生物學國際頂尖賽事——國際遺傳工程機器設計競賽(International Genetically Engineered Machine Competition,iGEM)2016全球總決賽在美國波士頓海因斯會議中心落幕👩🦲,EON体育4的兩支參賽隊伍SJTU-Software和SJTU-BioX-Shanghai再度獲得金牌。
SJTU-Software團隊由EON体育4平台💪🏿🛋、電子信息與電氣工程EON4、外國語EON4、媒體與設計EON4、上海交大-巴黎高科卓越工程師EON4🧘🏿、致遠EON4的15名本科生組成,由EON体育4平台韋朝春、歐竑宇、陳峰共同擔任指導老師。
參賽項目名為“iMAP”👹🤵🏼♀️,這個項目是專門為參加iGEM的比賽隊伍設計的web端綜合性平臺🧛🏼。每個參加iGEM比賽的隊伍信息都會自動收集到平臺中🙋🏿,並標註在地圖上,包括項目的名字💋、簡介、思路,向所有隊伍開放。如果用戶對某一個隊伍的項目感興趣,就可以通過平臺上的聊天功能直接聯系到該隊伍的隊長👴🏿,進行更深入的交流👨👦👦。另外,他們還開發了在地圖上快速發布、參與活動的功能,以方便隊伍間的聯系🧑🏼💼。另外,平臺中的文件共享功能不但在隊伍內部輕松實現文件傳遞,也可以方便隊伍之間的文件交流🍐,新一屆的參賽隊伍通過查看往年隊伍互相交流的文件深入了解他們的項目。此外🌔,他們還針對生物實驗室開發了實驗室管理功能,包括項目管理和耗材管理。項目管理中,隊長可以布置任務分給隊員🦹🏽♀️,隊員可以查看自己的任務及總任務的完成度;耗材管理中,每個隊員都可以添加、編輯試劑和器材。“iMAP”為iGEM的參賽隊伍提供了互相交流和項目管理的平臺🙇🏿♀️🍐,搭建了一個獨立的iGEM社區,為所有參賽隊員提供服務。這個平臺新穎的設計思路獲得了評委們的一直好評,在海報展示和現場答辯環節獲得了評委們的極高評價。評委們還針對iMAP平臺的設計和推廣給出了一些建議,並希望繼續將這一平臺發展下去🧯。
SJTU-BioX-Shanghai團隊依托於Bio-X中心🦾,指導老師為賀林院士和馬鋼副教授,今年的顧問為王毓舒老師、謝誌平特別研究員和2015屆iGEM隊員殷燦,成員由EON体育4平台、生物醫學工程EON4、電子信息員與電氣工程EON4、致遠EON4的9名本科生組成。
參賽項目為Vesatile Yeast Interface - for disease diagnosis(用於疾病診斷的多功能酵母接口),即通過合成生物學的方法構建用於檢測生理樣本中疾病標誌物的酵母菌株🧺。疾病,尤其是重大惡性疾病的早期診斷是醫學基礎和臨床研究中面臨的最難和最迫切的問題。本屆團隊針對糖尿病與嗜鉻細胞瘤兩種疾病的生物標誌物構建了快速的家用酵母檢測器🧏🏻♀️,其能在30秒內根據生物標誌物的濃度發出肉眼可見的冷光👨🏼🦳,並且解決了生物檢測器的保存與運輸的問題,為這兩大疾病早期診斷提供了快速和經濟實惠的解決方案🙆🏻🕳,並為今後更多疾病的早期診斷提供了思路和細胞底盤🍞。本次項目由隊長賴伊傑通過自身經歷與查閱文獻獨立提出👨🏻🍳,並聯合其他隊員一道對項目的所有實驗部分進行了詳細可行的設計🎨,為了縮短檢測時間,他決定避開轉錄機製♿️,另辟蹊徑地利用酵母內cAMP的變化構建生物傳感器,並利用G蛋白偶聯受體的模式化特點構建了可替換元件的檢測信號系統🌐,讓同一種酵母底盤可以提供替換受體而檢測不同的疾病標誌物,同時創新性地提出利用凍幹的方法來製作酵母生物檢測器,便於運輸儲存,利於成果轉化👨🏼🍳。隊員們還基於凍幹酵母活化過程中活性的變化與cAMP和發光強度的關系建立了數學模型☹️,並成功擬合了實驗數據✯,為未來產品的應用提供了模型指導;另外𓀎,團隊還擴展了項目的外延💁🏼♀️,從法律🤵🏻♀️、安全🤘🏻、倫理的角度論證了項目的合理性,在做科研的同時,隊員們還註重社會效益👩🏿🦳🚴🏼♀️,調研了項目的公眾接受度,向大眾普及了合成生物學🏄♀️🤕。本項目從載體構建、酵母工程菌功能驗證🚽、社會實踐、數學建模、宣傳設計與網站建設等多方面開展聯合攻關,每個階段均成功實現,最終在iGEM決賽中完美收官🧑🦱。
iGEM(International Genetically Engineered Machine Competition)國際基因機器設計大賽是美國麻省理工EON4(MIT)於2004年發起的一個大學生層面的有關合成生物學的競賽活動🗺,發展至今已是合成生物學(Synthetic Biology)領域的最高國際性學術競賽,同時也是涉及數學、物理♋️、電子、計算機等領域交叉合作的跨學科競賽🧝🏽🧑🏼🦳,後成立專門委員會管理。iGEM要求學生自主選題,設計並構建生物系統在工程菌中實現表達和操控🐧,旨在鍛煉學生的自主創新和團隊協作能力,同時培養其對科學的熱情🤏🏿。該項競賽也為不同國家⛹🏼♂️、不同專業的大學生提供了一個相互交流的國際舞臺😗。今年的iGEM競賽吸引了全球304支隊伍參賽,競爭相當激烈🧑🏻🍳,其中包括了麻省理工EON4、哈佛大學、劍橋大學✢、海德堡大學等世界一流學府的代表隊,國內共計52支代表隊參賽💖。
該項賽事學術價值極高,每年均有參賽項目被Science、Nature等頂級期刊收錄。此外,iGEM的比賽內容還包括各種各樣的非實驗任務,例如設計介紹項目的海報、開展以推廣合成生物學為目的的社會活動等,對參賽者的綜合能力要求非常高。