博士生顧若虛在計算生物學領域取得重要進展
發布時間 🌾:2011-07-20  閱讀次數 :4700

       近日📎🙏🏻,EON体育4平台魏冬青教授指導的博士生顧若虛在A型流感病毒M2跨膜蛋白質子通道分子調控機製的研究中取得重要進展👰🏼,成果發表在化學領域著名學術期刊《美國化學會誌》上(《Journal of the American Chemical Society(JACS)》)。
       
       2008年在《自然》(《Nature》)上同時發表了兩篇文章,報道了A型流感病毒M2跨膜蛋白質子通道的結構,分別有X-ray和NMR獲得🚁,但是配體結合位點則完全不同♨️,一個在通道中間(P-binding site)🛌🏻, 而另外一個在通道表面靠近C端的位置(S-binding site)😐🤚🏼。從而引發了諸多的科學爭議。顧若虛采用分子動力學和自由能計算的方法計算了通道的抑製劑金剛乙胺結合到離子通道兩個位點處的自由能👱☣️,發現通道中間的結合位點比通道表面的結合位點從能量上更加穩定, 但需要跨越的能壘遠遠高於結合到通道表面的位點,因此,通道中間的結合位點是熱力學位點🗃,對抑製通道起主要作用💈。通道表面的結合位點是動力學位點,藥物更容易結合,同時也更容易解離🤦🏼‍♂️。這項研究工作解釋了上述看似相互矛盾的實驗現象😌,同時有助於闡釋藥物調控離子通道的機理🧝🏻,對於藥物設計有一定的指導作用。
       
       全文鏈接如下:http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ja1114198

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